Углубленное профессиональное образование позволяет получить двухлетний курс магистерской программы по профилю промышленное рыболовство. Студентов учат: создавать методики по выбору и обоснованию параметров оборудования для рыболовства и процессам их эффективной эксплуатации; совершенствовать и реализовывать методы физического моделирования различных средств технического оснащения и создавать математические модели для промышленного рыболовства; определять и выбирать эксплуатационные и конструкционные свойства материалов, используемых в техническом оборудовании; проводить теоретические и экспериментальные исследования для промышленного рыболовного промысла и аквакультурных технических средств; разрабатывать проекты ТУ, стандарты и технические описания к новым рыболовным материалам и орудиям рыболовства; проектировать и рассчитывать технические объекты на промышленном производстве, опираясь на техзадание и используя стандартные, прикладные и профессиональные средства автоматизации проектирования; совершенствовать технологические процессы и операции, осуществляемые при постройке, механизации и автоматизации орудий, используемых в промышленном рыболовстве; разрабатывать и организовывать мероприятия для повышения показателей производственной эффективности с целью уменьшения расхода материалов, улучшения производительности труда и сокращения трудоемкости; оценивать экономическую эффективность процессов и технологий и рисков при внедрении инновационных методов и средств; организовывать работу коллектива с большим числом сотрудников; управлять процессом рыбной добычи, поиска и разведки рыбы на предприятиях с соблюдением международных и российских правил.