Обучение в магистратуре по этой специальности направлено на углубленное изучение методов исследования с использованием информационных технологий основных закономерностей природы. Магистранты изучают нелинейные процессы, гидродинамику, компьютерную оптику, электронные системы измерения, газодинамику, нанотехнологии. В зависимости от специализации преподаватели обучают магистрантов: математическому моделированию открытых нелинейных систем, математическому моделированию информационных систем, прикладным информационным технологиям в управлении и бизнесе, технологии и физике наноэлектронных приборов. Кроме этого, с учетом дополнительной образовательной педагогической программы, магистрантов готовят к педагогической деятельности.