Магистры направления «Агроинженерия» готовы к деятельности, которая требует углубленной профессиональной и фундаментальной подготовки, включая научно-исследовательскую работу, проектную, производственно-технологическую и организационно-управленческую деятельность. В случае освоения педагогического профиля образовательно-профессиональной программы – к работе педагогом. По окончании магистратуры выпускникам присваивается степень магистра технологий и техники. Возможно трудоустройство специалистом и руководителем отделений на машиностроительных предприятиях, станциях техобслуживания, в ВУЗах, организациях электроэнергетического комплекса, на агропромышленных комбинатах и других подобных учреждениях.
Магистры, устремившиеся в государственную сферу, нередко занимают руководящие посты в органах надзора и инспекциях. Они осуществляют разработку комплекса мер по обеспечению безопасности экологии, контролируют соблюдение установленных законом требований и предписаний. На крупных промышленных предприятиях необходимо обязательное наличие в штате специалиста, осуществляющего анализ производственных процессов с точки зрения их возможного вреда окружающей среде или человеку. В этих условиях выпускники становятся экспертами в соответствующих отделах. Умение использовать прикладные программы и осуществлять необходимые расчеты позволяет равным образом стать инженерами по технике безопасности на предприятии.
Специалисты работают на предприятиях по мясопереработке, производству хлебобулочных, кисломолочных и других заводах. Также дипломированных специалистов можно встретить в качестве сотрудников кафе и ресторанов. Там они работают технологами, взаимодействуя с поставщиками и службами государственного контроля. Они могут работать поварами или занимать администраторскую должность. В перспективе выпускники смогут стать шеф-поварами или ведущими технологами. Применение своим профессиональным умениям магистры смогут найти и в центрах стандартизации и сертификации. В различные организации, контролирующих процессы предоставления услуг общественного питания населению, регулярно требуются менеджеры по общественному питанию.
Магистров ждут в различных природоохранных фондах, лесничествах и лесозаготавливающих предприятиях. Приобретенные знания позволят оптимизировать технологический процесс воспроизводства лесных богатств, а также сохранения природного наследия. Востребованы те специалисты, которые обладают хорошим уровнем подготовки в области повышения продуктивности леса и улучшения породного состава. Также к профессиональной области относится и разумное использование земель и угодий. Большая часть выпускников трудоустраивается в национальные парки, заповедники, ботанические сады. Тем, кто хорошо знает иностранный язык, не следует ограничивать поиск только российскими организациями, а стоит направлять свои резюме в различные международные компании.