Основной областью применения прикладных знаний является гидрометеорологическая сфера. Магистрам необходимо осуществлять регулярный мониторинг состояния окружающей среды, применяя для этого современные и передовые технологии и методы в области инженерных, математических и технических направлений. Умение осуществлять комплексный анализ поступающей информации является основой успешной деятельности специалистов. Чаще всего магистры направляют свои резюме в комитеты Росгидромета. При этом они могут найти практическое применение своим навыкам и в частном секторе, работая в коммерческих компаниях, обслуживающих сферы строительства, авиации и мореплавания.
Выпускники могут работать ихтиологами, наблюдая за экосистемами водоемов искусственного и естественного происхождения. Многие успешно трудятся биологами и рыбоводами, изучая различные акватории и обитателей в них. Специалисты в научной области осуществляют разработку и внедрение различных методик для улучшения качества и количества объектов аквакультуры для выращивания. Диплом магистра дает возможность занимать ведущие позиции в коммерческих и государственных структурах, выполняя обязанности руководителя подразделений и впоследствии возможного занятия должности управляющего рыбоводческим предприятием.